WP2.8にアップグレードしたところ、管理画面のCSSが反映されず、レイアウトが崩れてしまってましたが、時間があったので調べてみたところ、すぐに解決できました。ありがとうございます。

WordPress › フォーラム » 2.8の管理画面のCSSが反映しない

ここを参考に.htaccessを修正しました。